3) Redécouper l'images en volumes (uniquement pour les images fonctionnelles)
Afin de traiter les images fonctionnelles il est nécessaire d'avoir un fichier images et son header par volume acquit au cours de la série.
Il faut donc redécouper le fichier unique obtenu dans l'étape précédente :
1) Toujours dans MRIcro, aller dans le menu "File" et cliquer sur "Open image".
2) Sélectionner l'image unique obtenue dans l'étape précédente et ouvrez le premier volume.
3) Toujours dans le menu "File" cliquer sur "Save as...[rotate/clip/format/4d->3d]"
4) Dans le petite boite de dialogue apparue, cliquer sur "Save[intel]".
5) Cliquer sur "Segment[File1,File2]" puis sélectionner le répertoire de destination de vos fichiers images.
6) Vous pouvez fermer MRIcro et constater dans le répertoire choisi la création d'un nombre d'images (avec leur fichier header) équivalent au nombre de volumes de la série.
7) Faire de même pour chaque série d'images.
8) On peut supprimer l'image unique qui a été créé à l'étape précédente, elle ne sera en effet plus d'aucune utilité.
On dispose à présent d'images pouvant être traitées par SPM2 et on peut passer à l'étape suivante : Le prétraitement des images.